Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms