Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR2F1P10589 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms