Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBSLP0DN79 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms