Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC172P0C7W6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms