Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFLP07196 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFLP07196 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFLP07196 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFLP07196 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms