Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC1P02654 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms