Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALX3O95076 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms