Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms