Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX3O75364 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms