Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms