Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms