Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLTPD2A6NH11 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLTPD2A6NH11 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms