Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms