Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms