Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PNMA8BQ9ULN7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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