Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK3Q9UBP4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms