Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms