Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4L1Q9NU39 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms