Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms