Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms