Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM54Q9BYV2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms