Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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