Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms