Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms