Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms