Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms