Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF48Q96MX3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms