Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAGED4Q96JG8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAGED4Q96JG8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms