Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BORCS6Q96GS4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms