Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CPNE2Q96FN4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms