Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ELP4Q96EB1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms