Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EXOSC8Q96B26 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms