Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms