Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PNLDC1Q8NA58 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms