Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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