Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX29P2Q8IUI4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms