Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS37DQ86XT2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms