Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms