Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms