Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF123Q5XPI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms