Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms