Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms