Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms