Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms