Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIDA1Q1XH10 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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