Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPROQ16827 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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