Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS72Q15906 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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