Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USF2Q15853 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF2Q15853 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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