Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEBPEQ15744 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms