Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ELOBQ15370 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELOBQ15370 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms